Hijo de Sebastián de Cabezón y María Gutiérrez, nació en Castrillo de Mota de Judíos, localidad en la que vivió con su familia para posteriormente trasladarse a Palencia al servicio de un obispo.

Ciego desde la infancia, superó esta limitación que no le impedirá desarrollar una brillante carrera musical, sirviendo como organista de la reina de Portugal en 1526, alcanzando el reconocimiento como músico de cámara de Carlos V en 1538.

Su importancia musical irá creciendo al servicio de los miembros de la corona española, destacando sus trabajos para las infantas María y Juana, y Felipe II, al que acompañó en sus viajes por Europa, asombrando por su calidad musical como intérprete organista y compositor.

Residente en España en las ciudades de Ávila y Madrid, dedicó en ellas parte de su tiempo a la composición musical, que aparece reflejada en los libros Cifra nueva de Venegas y la edición de sus obras por su hijo Hernando, en 1578, doce años después de su muerte, en las que se incluyen obras para instrumentos de tecla y vocales.

Macario Santiago Kastner subraya que Cabezón fue uno de los principales intérpretes y compositores de tecla de su época.

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